Osnovni ciljevi rada Društva za zaštitu bilja u BiH su:
ostvarivanje zajedničkih interesa u oblasti zaštite bilja u Bosni i Hercegovini;
okupljanje naučnih radnika i stručnjaka koji se bave zaštitom bilja u cilju uzajamnog rada i unapređenja zaštite bilja u Bosni i Hercegovini u svim njenim segmentima;
podsticanje naučno-istraživačkog rada u oblasti zaštite bilja;
zaštita prirode i čovjekove okoline, te rad na uvođenju integralne i ekološke zaštite bilja;
proučavanje i čuvanje naučne, prirodne i kulturne baštine iz oblasti zaštite bilja;
podsticanje i posredovanje u otvaranju novih radnih mjesta iz oblasti zaštite bilja.
organizovanje predavanja i seminara za članove Društva i proizvođače;
aktivno učešće u izradi zakonske regulative iz oblasti zaštite bilja;
učešće u izradi nastavnih planova i programa na svim nivoima obrazovanja stručnjaka za zaštitu bilja;
izdavanje naučno-stručnih časopisa, brošura i knjiga iz oblasti zaštite bilja;